⏳ This skill is pending AI review.
Scores will appear once the review pipeline completes.
build-scientific-visualizations
Use when creating, redesigning, planning, or visually auditing scientific figures, flowcharts, method schematics or model-architecture diagrams, graphical abstracts, dense many-panel compound figures, domain-specific omics visualizations, and conference or journal figure sets, including Nature-style main, Extended Data, and Supplementary figures. Independently owns visual construction, figure legends, source-data preparation, and visual QA; does not rewrite the scientific analysis or manuscript claims.
Choose how to use this skill
You do not need every option. Choose the path your AI client supports. The stable page stays the same; versioned files are immutable.
1. Native installer
This listing has no registered native installer command. Use the complete package or source fallback below, depending on what your client supports.
Do not guess an installer command or replace an existing version without reviewing the diff.
2. Complete package recommended
Download the ZIP when available. It includes SKILL.md plus the references, security notes and version metadata.
No complete ProSkills package is published for this listing yet.3. Prompt-only
Copy the prompt above when the agent can read the stable page or when you want to adopt the workflow without installing a skill.
Need only the instruction file?
Download SKILL.md only if your client requires a single file. The complete ZIP is safer for a full installation because it preserves the references and release context.
No path installs or executes anything by itself. Your agent still needs access to the project files. Before updating, compare the installed version and review the diff.
// RATINGS
// README
Open Research Skills
让科研材料成为清楚的论证、可编辑的图件和可复用的成果。
科研绘图 · 顶会论文 · 期刊论文 · 基金 proposal · 科研全流程
选择 skill · 专项任务与打磨 · 快速开始 · 绘图 · 会议论文 · 期刊论文 · 基金 · 研究工作流 · 对照评测
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这是一个面向日常科研的 agent skill 工具箱。十个完整 skill 在一个仓库中维护,每个都能单独安装、独立使用。您可以从一张图、一段 Results 或一个研究问题开始,不必先启动整套研究流程。
两行装上
Claude Code —— 十个一次装齐,装完用 /open-research-skills:<skill-name> 调用:
claude plugin marketplace add gxCaesar/open-research-skills
claude plugin install open-research-skills@open-research-skills
Codex($HOME/.agents/skills/ 也是 Antigravity CLI 的项目级目录名):
git clone https://github.com/gxCaesar/open-research-skills.git
cd open-research-skills && bash scripts/install_skills.sh "$HOME/.agents/skills"
只装其中一两个、或换其他 runtime,见快速开始。
装上之后能得到什么
上:Nature 风格机制图。下:顶会风格模型架构图。先用 GPT 图像生成探索构图,再复刻为原生 PPTX 对象。 这里展示的是导出预览;下载 PPTX 后可直接修改文字、细胞轮廓、矩阵、连线和模块位置,也提供矢量 PDF 与 SVG。 两图都是教学示意,不代表真实实验结果。 机制图 PPTX · 架构图 PPTX · 下载矢量文件与学习修改
一次真实调用长这样:
使用 build-scientific-visualizations。按 notes/method.md 画方法架构图,
两栏宽,导出可编辑 PPTX 和矢量 PDF。
论文、基金和整条研究流程同理:说清材料在哪、这次要交付什么、允许改到什么程度。
选择您这次需要的 skill
总览图 PPTX · English PPTX · 图件学习说明
| 您现在的任务 | 入口 | 典型交付 |
|---|---|---|
| 把方法、机制或多组学结果画清楚 | 科研绘图 | 可编辑架构图、多面板图、矢量文件与 legend |
| 从材料成稿,或修改顶会论文 | 会议论文 | 论文与附录、结果论证、rebuttal、camera-ready |
| 组织期刊论文与投稿、修回材料 | 期刊论文 | 稿件、图注、数据声明、cover letter、审稿回复 |
| 准备研究基金申请材料 | 基金 proposal | 科学问题、证据需求、研究内容、章节 brief、审阅建议 |
| 判断课题并推进实验、成稿与交付 | 研究工作流 | 可行性判断、比较结果、下一步实验与复现材料 |
| 判断研究方向是否值得开展 | 调研与新颖性审计 | 数据可行性、新颖性与 venue fit 的独立判断 |
| 方法仍落后于基线,决定下一步改哪里 | 方法迭代到 SOTA | 可测提升空间、误差分层、候选机制与对照结果 |
| 投稿前审查自己的论文 | 冷审 panel | 独立视角的问题清单、证据位置与修改优先级 |
| 受邀评审别人的投稿 | 受邀审稿 | 保密边界、审稿意见与返修轮对齐 |
| 发布代码与数据 | 代码与数据发布 | 可分发代码包、运行说明、数据入口与验证结果 |
按本次要交付的东西选择即可。论文 skill 能独立处理论文需要的图件,研究工作流能独立组织成稿;专门的绘图 skill 提供更丰富的设计支持,但不是其他 skill 的强制依赖。
教程以 AI 与生物研究为主,覆盖单细胞、扰动预测和空间多组学;组织材料、科学写作和交付方法也可迁移到其他领域。下文说明十项能力怎样用于真实科研,十份独立中文手册进一步展开材料准备、逐阶段操作、调用示例和交付检查。绘图提供可编辑成品;小型教学脚本作为可选练习,不代表完整科研能力或真实实验效果。
专项任务与打磨:不用从完整流程开始
下面既有可独立使用的 skill,也有现有 skill 内的局部任务。按表中的入口调用,说明材料位置、目标与允许修改的范围。
| 这次只想做什么 | 使用入口与操作说明 | 主要交付 |
|---|---|---|
| 检查标题、起草或压缩摘要 | 会议或期刊 skill 的摘要组件:会议/期刊 | 标题建议、摘要或只读诊断,按适用要求核对字数与主张 |
| 打磨一节,或继续下一节 | polish:会议逐节流程/期刊逐节流程 | 本节修订、实际检查结果、完成状态与下一节位置 |
| 审查并打磨全文、整理终稿 | 会议全稿流程/期刊修订与交付 | 范围内完整修订、跨文件核对、可阅读稿与本地候选包 |
| 只审稿,不改原文 | 会议或期刊 skill 的 audit:会议/期刊 | 有位置、证据、影响和最小修正建议的问题清单 |
| 核查统计表述、图注与引用 | 会议或期刊 skill,明确指定这些材料 | 来源与分母核对、表述修订或待解决问题,不重新选择分析 |
| 精修已有图件 | 绘图 skill 的局部修改与精修 | 可编辑修订、前后渲染比较与所需导出 |
| 深读一篇论文 | 工作流 survey 的单篇深读 | 问题、方法、实验、证据位置和限制的 Paper Card |
| 打不过基线,决定下一步改哪里 | 方法迭代到 SOTA | 实测 headroom 与噪声底、误差分层表、一次一个组件加可 void 对照的结果 |
| 判断一个方向还开不开着 | 调研与新颖性审计 | 贡献车道、变量共存计数表、分开记录的撞车/可行性/venue 判词与击杀层 |
| 投稿前让没看过项目的人挑毛病 | 冷审 panel | 可核验的隔离清单、逐视角发现、真跑过 artifact 的记录与裁决排序 |
| 受邀评审别人的投稿 | 受邀审稿 | 保密边界判断、编辑可执行的意见、严重度标定与返修轮对齐表 |
| 打一个匿名或可引用的代码数据包 | 代码与数据发布 | 白名单文件清单、暂存树身份扫描、成品包内的验证运行记录 |
| 从一组论文学习写作与图件组织 | 工作流 survey 的论文集合分析 | 带出处的 Results 组织、图序、图注与主补安排观察 |
| 审阅基金原稿或组织研究方案 | 基金 proposal 手册 | 论证问题、带注释的章节 brief、政策允许范围内的图件协助 |
单节、逐节与全文任务的边界不同。 “只改 Results”到该节完成为止;“继续下一节”先读取已有进度和当前稿件;明确要求逐节完成全文时,可以在授权范围内连续推进。单节检查通过不等于整稿完成,全部目标章节完成后还需核对跨节与主补材料的一致性。只读审查不自动转成修改。
快速开始
1. 获取仓库,找到本次任务的手册
git clone https://github.com/gxCaesar/open-research-skills.git
cd open-research-skills
不想先配置 agent?可以先阅读手册或打开成品:
- 想看图件:空间多组学复合图。
- 想写论文:会议论文使用手册或期刊论文使用手册。
- 想推进课题:从研究问题到发表的完整手册。
- 想立即运行:扰动预测教学比较,只需 Python 标准库。
2. 安装一个完整 skill
下面用绘图 skill 和仓库旁的 research-demo 练习项目演示。在仓库根目录执行;已有科研项目时,将 RESEARCH_PROJECT 改为那个项目的实际路径。
RESEARCH_PROJECT="$PWD/../research-demo"
SKILL_NAME=build-scientific-visualizations
SKILL_DEST="$RESEARCH_PROJECT/.agents/skills"
mkdir -p "$SKILL_DEST"
if test -e "$SKILL_DEST/$SKILL_NAME" || test -L "$SKILL_DEST/$SKILL_NAME"; then
echo "目标已存在,未覆盖;请先保留并比较本地修改。"
else
cp -R "skills/$SKILL_NAME" "$SKILL_DEST/"
fi
test -f "$SKILL_DEST/$SKILL_NAME/SKILL.md"
上面是 Codex 与 Antigravity CLI 的项目级安装 —— .agents/skills/ 是这两个 runtime 共用的
项目级目录名,一份拷贝两边都读得到。(全局级不共用:Codex 是 $HOME/.agents/skills/,
Antigravity CLI 是 $HOME/.gemini/antigravity-cli/skills/。)使用 Claude Code 时,把 SKILL_DEST 那行换成
SKILL_DEST="$RESEARCH_PROJECT/.claude/skills",再执行后面的复制步骤。
Claude Code 可以两行装齐十个,不必逐个复制目录:
claude plugin marketplace add gxCaesar/open-research-skills
claude plugin install open-research-skills@open-research-skills
仓库同时是 marketplace 和 plugin 本身,所以两条命令指向同一个名字。
装完怎么调用。 插件安装的 skill 是带命名空间的,形式为 /open-research-skills:<skill-name>,
例如 /open-research-skills:build-scientific-visualizations。命名空间不是装饰:它意味着
即使您自己的 $HOME/.claude/skills/ 里已经有同名 skill,两个也会同时加载、互不覆盖 ——
不必为了装这个仓库去改名或删掉您自己的那份。直接用自然语言点名 skill
// HOW IT'S BUILT
KEY FILES